Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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