Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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