Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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