Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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