Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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