Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms