Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln3Q8C5U9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms