Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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