Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms