Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms