Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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