Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rnf41Q8BH75 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf41Q8BH75 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf41Q8BH75 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf41Q8BH75 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf41Q8BH75 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf41Q8BH75 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf41Q8BH75 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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