Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms