Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms