Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms