Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Ttc28Q80XJ3 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Ttc28Q80XJ3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Ttc28Q80XJ3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms