Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms