Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccp110Q7TSH4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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