Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc2bQ7TPM1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms