Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim12Q78RX3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim12Q78RX3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim12Q78RX3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim12Q78RX3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim12Q78RX3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim12Q78RX3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim12Q78RX3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim12Q78RX3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim12Q78RX3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim12Q78RX3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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