Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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