Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

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Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zbtb40Q6PCS8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zbtb40Q6PCS8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zbtb40Q6PCS8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zbtb40Q6PCS8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zbtb40Q6PCS8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Zbtb40Q6PCS8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Zbtb40Q6PCS8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb40Q6PCS8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Zbtb40Q6PCS8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms