Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms