Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CltbQ6IRU5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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