Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms