Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc2Q69ZB8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms