Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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