Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9bQ66X22 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp9bQ66X22 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms