Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.3 ms