Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim25Q61510 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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