Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms