Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TmpoQ61033 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms