Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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DbpQ60925 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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DbpQ60925 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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DbpQ60925 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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DbpQ60925 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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DbpQ60925 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DbpQ60925 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms