Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a1Q60737 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms