Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms