Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf12Q5SPL2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms