Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWD4

Gm20816, Predicted gene, 20816, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20816Q5FWD4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20816Q5FWD4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm20816Q5FWD4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm20816Q5FWD4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20816Q5FWD4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms