Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms