Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms