Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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