Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc185Q3V118 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc185Q3V118 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc185Q3V118 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc185Q3V118 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc185Q3V118 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc185Q3V118 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc185Q3V118 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc185Q3V118 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc185Q3V118 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc185Q3V118 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.3 ms