Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms