Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms