Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms