Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms