Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms