Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms