Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms