Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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