Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms